Η υποχρέωση κατάθεσης των συμφωνητικών στις Δημόσιες Οικονομικές Υπηρεσίες (ΔΟΥ) εντός δέκα ημερών έχει αντικατασταθεί από την υποβολή τριμηνιαίων καταστάσεων, γεγονός που έχει απλοποιήσει τη διαδικασία και έχει μειώσει τη γραφειοκρατία. Έτσι, οι επιχειρήσεις δεν χρειάζεται πια να καταθέτουν κάθε συμφωνητικό ξεχωριστά στις ΔΟΥ, αλλά μπορούν να τα περιλαμβάνουν στις τριμηνιαίες τους καταστάσεις.
Πρόσφατα, το Συμβούλιο της Επικρατείας (ΣτΕ) εξέτασε περιπτώσεις όπου η φορολογική αρχή αμφισβήτησε τη νομιμότητα ορισμένων συμφωνητικών, επειδή δεν είχαν κατατεθεί εντός της προθεσμίας των δέκα ημερών, σύμφωνα με την προηγούμενη νομοθεσία. Η απόφαση του ΣτΕ έκρινε ότι η μη υποβολή των συμφωνητικών στις τριμηνιαίες καταστάσεις δεν αποτελεί επαρκή λόγο για την επιβολή πρόσθετου φόρου, εφόσον η ύπαρξη του συμφωνητικού δεν αμφισβητείται από την έκθεση ελέγχου.
Συγκεκριμένα, όταν η φορολογική αρχή αμφισβήτησε ένα συμφωνητικό επειδή δεν είχε θεωρηθεί εντός της δεκαήμερης προθεσμίας, το Δικαστήριο αποφάσισε ότι η φορολογούμενη επιχείρηση δεν είχε πλέον υποχρέωση να τηρεί αυτή τη διαδικασία, καθώς είχε τεθεί σε εφαρμογή η νέα διαδικασία των τριμηνιαίων καταστάσεων. Το Δικαστήριο διαπίστωσε ότι η φορολογική διοίκηση δεν είχε προβάλλει το επιχείρημα της μη υποβολής μέσω των τριμηνιαίων καταστάσεων κατά τη διάρκεια της δίκης και στην έκθεση ελέγχου. Ως αποτέλεσμα, αναγνώρισε την έκπτωση φόρου που είχε ζητήσει η επιχείρηση.
Η απόφαση του Συμβουλίου της Επικρατείας επηρεάζει την εφαρμογή της φορολογικής νομοθεσίας, επιβεβαιώνοντας ότι η απουσία συμφωνητικών στις τριμηνιαίες καταστάσεις δεν μπορεί να οδηγήσει σε επιπλέον φόρους, εφόσον τα συμφωνητικά αναγνωρίζονται και η ύπαρξή τους δεν αμφισβητείται. Αυτό σημαίνει ότι οι επιχειρήσεις δεν θα υποστούν πρόσθετους φόρους εξαιτίας της αλλαγής στη διαδικασία υποβολής των συμφωνητικών, εφόσον έχουν τηρήσει τη νέα διαδικασία που απαιτεί την τριμηνιαία υποβολή.